Η προτεινόμενη οργάνωση της διδασκαλίας και οι μέθοδοι που χρησιμοποιήθηκαν προωθούν, ενισχύουν και ενθαρρύνουν την ενεργοποίηση του μαθητή, τον πειραματισμό και την εμπλοκή του σε διαδικασίες μέσα από τις οποίες θα προσεγγίζει ο ίδιος τη συνεργατική και ανακαλυπτική γνώση.Ο μαθητής συζητάει με την ομάδα, δέχεται πληροφόρηση με εποπτικό υλικό  και ως ένα βαθμό αυτενεργεί. Στο τέλος κάθε φάσης συμπληρώνεται ένα φύλλο εργασίας που ανταποκρίνεται στους διδακτικούς στόχους όπως:

α) να επικεντρώσει την προσοχή του μαθητή παρατηρώντας τη δομή της πλασματικής μεμβράνης και να κατανοήσει τις λειτουργίες της που απορρέουν από τη δομή αυτή

β) να σχεδιάσει τη δομή της πλασματικής μεμβράνης έτσι ώστε να αποτυπώσει τα δομικά μόρια και συγχρόνως να προβληματιστεί για το σκοπό της ύπαρξη τους

γ) να εκτιμήσει την πλασματική μεμβράνη ως μια σημαντική «ζωντανή» δομή, με έμφαση στον όρο ρευστό μωσαϊκό, και όχι σαν ένα απλό όριο που διαχωρίζει το κύτταρο από το περιβάλλον.

Όσον αφορά τις φάσεις α) στην πρώτη φάση καλείται ο μαθητής με τη βοήθεια εποπτικού υλικού (εικόνες κυττάρων) να ανακαλέσει τις γνώσεις του για  τη δομή των ευκαρυωτικών κυττάρων και να απαντήσει ατομικά σε μια σειρά καρτών.

β) στη δεύτερη φάση ο μαθητής καλείται να αυτενεργήσει με εργαστηριακή άσκηση που εκτελεί ο ίδιος και να παρατηρήσει στο μικροσκόπιο την πλασματική μεμβράνη. Αποκτάται έτσι βιωματικά η γνώση για το που και ποια είναι η πλασματική μεμβράνη συμπληρώνοντας παράλληλα το συνοδευτικό φύλλο εργασίας.

γ) Στην τρίτη φάση ο μαθητής ενεργοποιείται με την προβολή ενός διαδραστικού  βίντεο με ερωτήσεις. που παρεμβάλλονται με σκοπό να καθοδηγήσουν το μαθητή και την ομάδα του να αναπαράγει την πληροφορία, να προβληματιστεί, να ανακαλέσει γνώσεις, να συσχετίσει πληροφορίες, να συμπεράνει, να αναθεωρήσει και να καταλήξει στη σωστή απάντηση.

και τέλος δ) στην τέταρτη φάση έχουμε βιωματική άσκηση με τους μαθητές να παριστάνουν τη διπλοστιβάδα της μεμβράνης πιασμένοι χέρι-χέρι προσομοιάζοντας τη λειτουργία της μεμβράνης κάτω από τους ήχους μουσικής που συμβολίζει την ιδιότητα της κίνησης της πλασματικής μεμβράνης.